孕妇刑事案件的处理方式有：
1、在侦查阶段、审查起诉阶段发现犯罪嫌疑人、被告人怀孕的，可取保候审。
2、对于符合逮捕条件，但是怀孕妇女，可以对其采取监视居住的措施。
3、对于审判的时候怀孕的妇女，不适用死刑。对于在执行死刑时发现怀孕的罪犯，应立即停止执行。
4、对于被判处有期徒刑或者拘役的罪犯，有怀孕妇女的，可以暂予监外执行。
5、如果其被判处拘役或三年以下有期徒刑，同时符合下列条件的，则可以适用缓刑：
（一）犯罪情节较轻；
（二）有悔罪表现；
（三）没有再犯罪的危险；
（四）宣告缓刑对所居住社区没有重大不良影响。
如果不适用缓刑的，那么对于被判处拘役或者有期徒刑的孕妇也可以监外执行。
【法律依据】
《刑法》第四十九条，犯罪的时候不满十八周岁的人和审判的时候怀孕的妇女，不适用死刑。
审判的时候已满七十五周岁的人，不适用死刑，但以特别残忍手段致人死亡的除外。
《刑事诉讼法》第二百六十二条，下级人民法院接到最高人民法院执行死刑的命令后，应当在七日以内交付执行。但是发现有下列情形之一的，应当停止执行，并且立即报告最高人民法院，由最高人民法院作出裁定：
（一）在执行前发现判决可能有错误的；
（二）在执行前罪犯揭发重大犯罪事实或者有其他重大立功表现，可能需要改判的；
（三）罪犯正在怀孕。
前款第一项、第二项停止执行的原因消失后，必须报请最高人民法院院长再签发执行死刑的命令才能执行；由于前款第三项原因停止执行的，应当报请最高人民法院依法改判。
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