套牌的处理方式需要根据具体情况分析：
（1）套牌车被交警查到，交通执法部门会依法扣留该机动车，记12分，处十五日以下拘留，并处二千元以上五千元以下罚款；
（2）对于构成犯罪的，需要依法追究刑事责任。伪造、变造、买卖机动车牌证及机动车入户、过户、验证的有关证明文件的，构成犯罪的，处三年以下有期徒刑、拘役、管制或者剥夺政治权利，并处罚金;情节严重的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金。
车辆被套牌后需要进行以下处理：
1、搜集一切有利的证据。在确定被人套牌后要果断开始收集一切有利的证据，包括车辆外观的照片、各种停车小票、高速收费小票、行车记录仪、甚至停车场和小区的监控录像；
2、向交管部门提交申诉。在收集到以上的证据后，就可以到交管部门去提出车辆被套牌申诉。可以选择车辆登记所在地的交管部门申诉，也可以去违章所在地进行申诉；
3、申请更换车辆牌号。申诉成功后，交管部门会开具车辆被套牌说明。可以到车管所申请更换牌号。
【法律依据】
《道路交通安全法》第九十六条，伪造、变造或者使用伪造、变造的机动车登记证书、号牌、行驶证、驾驶证的，由公安机关交通管理部门予以收缴，扣留该机动车，处十五日以下拘留，并处二千元以上五千元以下罚款；构成犯罪的，依法追究刑事责任。
伪造、变造或者使用伪造、变造的检验合格标志、保险标志的，由公安机关交通管理部门予以收缴，扣留该机动车，处十日以下拘留，并处一千元以上三千元以下罚款；构成犯罪的，依法追究刑事责任。
使用其他车辆的机动车登记证书、号牌、行驶证、检验合格标志、保险标志的，由公安机关交通管理部门予以收缴，扣留该机动车，处二千元以上五千元以下罚款。
当事人提供相应的合法证明或者补办相应手续的，应当及时退还机动车。
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