驾驶证扣分超过12分怎么处理需根据具体情况分析。
一、持有大型客车、牵引车、城市公交车、中型客车、大型货车驾驶证的驾驶人，在一个记分周期内有记满12分记录的，车辆管理所应当注销其最高准驾车型驾驶资格，并在三十日内办理降级换证业务。实习期间扣满12分应当注销降级。
二、C类驾照一个记分周期内累积记分达到12分的，公安机关交通管理部门应当扣留其机动车驾驶证。实习期扣满12分应当主要驾驶证。
三、机动车驾驶人在一个记分周期内有两次以上达到12分或者累积记分达到24分以上的，车辆管理所还应当在道路交通安全法律、法规和相关知识考试合格后十日内对其进行道路驾驶技能考试。接受道路驾驶技能考试的，按照本人机动车驾驶证载明的最高准驾车型考试。
机动车驾驶证一次扣12分的情形包括：
（一）饮酒后驾驶机动车的；
（二）造成致人轻伤以上或者死亡的交通事故后逃逸，尚不构成犯罪的；
（三）使用伪造、变造的机动车号牌、行驶证、驾驶证、校车标牌或者使用其他机动车号牌、行驶证的；
（四）驾驶校车、公路客运汽车、旅游客运汽车载人超过核定人数百分之二十以上，或者驾驶其他载客汽车载人超过核定人数百分之百以上的；
（五）驾驶校车、中型以上载客载货汽车、危险物品运输车辆在高速公路、城市快速路上行驶超过规定时速百分之二十以上，或者驾驶其他机动车在高速公路、城市快速路上行驶超过规定时速百分之五十以上的；
（六）驾驶机动车在高速公路、城市快速路上倒车、逆行、穿越中央分隔带掉头的；
（七）代替实际机动车驾驶人接受交通违法行为处罚和记分牟取经济利益的。
【法律依据】
《机动车驾驶证申领和使用规定》第七十一条，公安机关交通管理部门对机动车驾驶人的道路交通安全违法行为，除依法给予行政处罚外，实行道路交通安全违法行为累积记分制度，记分周期为12个月，满分为12分。
机动车驾驶人在一个记分周期内记分达到12分的，应当按规定参加学习、考试。
