离婚时公司股权的处理如下：
一、如果是仅有夫妻二人持股的有限公司，夫妻二人愿意继续持有股份的，均分股份；夫妻一人不愿意持股，将股份作价一半补偿给愿意持股方；夫妻都不愿意继续经营的，可以对公司资产进行清算，夫妻分割清算后的资产，并注销公司。
二、夫妻一方以共同财产出资与第三人持股的有限公司，直接转让股权，或者股权在夫妻间不发生转移，持股配偶一方将本属于另一方的股份折价后，以货币的形式对另一方进行补偿。
需要注意的是，公司股权不一定是夫妻共同财产。公司股权是否属于夫妻共同财产与其取得时间、方式以及是否有婚内财产协议有关。婚前取得公司股权不属于夫妻共同财产，婚后取得的股权一般属于夫妻共同财产。根据相关法律规定，通过遗嘱或者赠与合同取得的婚前财产属于个人财产。夫妻可以约定婚姻关系存续期间的财产归属，约定应当采用书面形式。
一般夫妻共同财产应包括下列内容：
（一）夫妻双方各自的工资、奖金;
（二）生产、经营性的收益;
（三）知识产权的收益：是指婚姻关系存续期间，实际取得或者已经明确可以取得的财产性收益;
（四）继承或接受赠予所得的财产;
（五）军人名下的复员费、自主择业费等一次性费用的，以夫妻婚姻关系存续年限乘以年平均值的所得额;
（六）一方以个人财产投资取得的收益;
（七）男女双方实际取得或者应当取得的住房补贴、住房公积金;
（八）男女双方实际取得或者应当取得的养老保险金、破产安置补偿费。
【法律依据】
《民法典》第一千零七十六条，夫妻双方自愿离婚的，应当签订书面离婚协议，并亲自到婚姻登记机关申请离婚登记。
离婚协议应当载明双方自愿离婚的意思表示和对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的意见。
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