夫妻离婚有两个孩子，如果双方可以就孩子抚养协商一致，按照双方当事人的意思出具判决书。
如果双方在两个孩子抚养权问题上存在比较大争议时，法院一般会从缓和家庭矛盾和公平的角度出发，判决一方抚养一个孩子的概率会比较大。
判决抚养的时候法院会参考孩子的年龄，性别等因素进行判决，通常情况下，两周岁以内的子女原则上女方抚养，两周岁以上的子女法院会按照有利子女成长的原则判决，八周岁以上的子女可以征求孩子意见。
当然法院在对于抚养权归属的判决上，也会遵循未成年子女的最大利益的原则，如果一方出现不适合抚养子女的情况，比如说有吸毒，赌博等恶习，患有久治不愈的艾滋病，梅毒等传染性疾病，或者其他严重疾病的，或者一方曾经有家庭暴力，或者有虐待遗弃家庭成员行为的，同时一方长期不履行抚养义务等等这些情形，法院就有可能将两个孩子的抚养权都判归给一方。
在判决抚养权时法院一般会从以下四个方面来对比双方谁更有利于孩子的成长，更适合抚养孩子：
1、双方的基本条件
即使夫妻双方的基本条件，如工资收入、教育程度等差异不大，但并不表示就没有差。比如，一方的思想品质，就在争取孩子抚养权方面尤为重要，因为直接抚养方的思想品质，会直接影响下一代的健康成长。因此，取得这一方面的证据，是比较重要的。
2、双方父母的基本条件
城市生活节奏较快，很多时候，真正带孩子的往往不是夫妻任何一方，特别是对于学龄前儿童，通常是一方的父母带。因此，孩子以往的生活环境，以及长期带孩子的父母的意见及身体情况，往往也是影响孩子抚养权的一个重要方面。
3、孩子的生活环境
离婚案件中孩子抚养问题的处理原则，是不影响孩子的健康成长。如果双方离婚，但有一方距离学校较近，或生活小区成熟，对孩子入学、生活最为有利，当然得到孩子抚养权的可能性就会更大。因此，这方面的取证工作也是必须的。
4、孩子的意见
一般，法院在处理抚养问题上，会认真听取八周岁以上孩子的意见。
【法律依据】
《民法典》第一千零八十四条，父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。
离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。
离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。
